Вопросы местным:
1) Так понимаю, что таксобусы сперва не имели своих номеров из разряда 1хх и просто дублировали номер маршрута троллейбуса? Может, чтоб не путать с автобусами с таким же номером, стоит к номеру маршрута добавить "taksobuss" в поле Примечание?

2) Есть несколько фото (ссылки ниже), где автобусы с табличкой "экспресс". Это маршруты 3E, 37E? Или тогда это был один маршрут с "экспрессовыми рейсами"?
http://fotobus.msk.ru/photo/2567412/
http://fotobus.msk.ru/photo/2567407/
http://fotobus.msk.ru/photo/2567383/

3) Вот это: http://fotobus.msk.ru/photo/2567398/ 40Е или что-то другое, не имевшее номера?

1) Да, так можно.
2) Это маршруты 3е, 37е.
3) Это скорее 40R (Cetrālā stacija - Robotu rūpnīca), потом до Зиепниеккалнс.