Я если честно, не вижу особого смысла вносить шестизначные сквозные номера для тех моделей ТС, что работали до её введения в сентябре прошлого года (именно в сентябре, не в феврале как некоторые думают). На мой взгляд, смысл вносить вижу только для моделей, работавших на момент её введения.

Что скажу про саму нумерацию, то я её примерную расшифровку покажу на примере машины № 46021 (учебка из Ступинского ПАТП) - её номер по новой нумерации - 031006. В данном случае: 03 - номер МАПа, 1 - номер гаража (в МАП №3: 0 - отстранённая от работы машина, 1 - Ступинское ПАТП, головной филиал, 2 - Каширское ПАТП, головной филиал, 3 - Ступинское ПАТП, филиал в Малино и 4 - Каширское ПАТП, филиал в Серебряных Прудах) и 006 - номер самой машины.

Нумерация не сквозная.
Ввод нумерации осуществлялся соответствующим приказом по предприятию по присвоению бортовых номеров, а не расклейкой наклеек на подвижном составе. Соответственно, датой присвоения бортового номера является дата приказа.

В данном случае третья позиция - номер отряда.
У МАП-3 он совпадает с филиалам, кроме "нулевого" отряда - это техколонна всего МАПа, куда относятся в том числе и отстраненные решением комиссии машины.