| 2 | Станция метро "Речной вокзал" — Котельная | | МУП "ПАТП-4" | | 18.08.2006 | 31.05.2008 | |
| 2э | Станция метро "Речной вокзал" — Общественный торговый центр | | МКП "ПАТП-4" | | 01.06.2008 | 31.08.2009 | |
| 6 | ПСК "Берёзка" — станция Издревая | | МКП "ПАТП-4" | | ≤ 1994 | 13.06.2012 | |
| 8э | Станция метро "Речной вокзал" — Цветной проезд | | МКП "ПАТП-4" | | 1973 | 01.08.2013 | |
| 12 | Автовокзал — ТЭЦ-5 | Новосибирск: закрытые городские перевозчики | МУП "ПАТП-4"
МУП "ПАТП-3" | | 1975 | 11.2003 | |
| 20 | СТЦ "Мега" — Улица Твардовского | | Автоучасток №1 | | 05.2013 | 28.02.2022 | |
| 25к | метро "Заельцовская" — в/ч №34024 | | ИП Бондаренко Игорь Александрович | | 03.2010 | 07.2012 | |
| 38 | УМ-3 — Общественный торговый центр | | МКП "ПАТП-4" | | 24.11.2003 | 05.05.2013 | |
| 39э | Цветной проезд — ГНЦВБ "Вектор" (Кольцово) | | МКП "ПАТП-4" | | 18.08.2006 | 13.06.2012 | |
| 41 | Цветной проезд — Краснообск | | ООО "Транском-Новосибирск" | | 02.2010 | 04.2012 | |
| 56 | Краснообск — НГАУ | | Прочие маршрутные автобусы | | 2007 | 2011 | |
| 62 | Железнодорожный вокзал "Новосибирск-Главный" — Улица Амбулаторная | | МУП "Дзержинское троллейбусное депо №1" | | 01.01.2005 | 2005 | |
| 68у | Станция метро "Речной вокзал" — НЗЖБИ-2 | | МУП "ПАТП-4" | | 01.1986 | 31.01.2007 | Экспресс |
| 68э | Станция метро "Речной вокзал" — Улица Твардовского | | МКП "ПАТП-4" | | 01.02.2007 | 20.03.2011 | Экспресс |
| 69 | Станция Матвеевка — Улица Твардовского | | Автоучасток №1 | | 1986 | 20.02.2022 | |
| 70э | Метро "Речной вокзал" — ГНЦВБ "Вектор" (Кольцово) | | МКП "ПАТП-4" | | 12.07.1996 | 13.06.2012 | |
| 102 | Дом культуры Железнодорожников — станция Издревая | | МП "ПАТП-4" | | | ≤ 1994 | |
| 116 | ПСК "Берёзка" — станция Издревая | | МКП "ПАТП-4" | | 13.06.2012 | 05.05.2013 | |
| 140 | Метро "Речной вокзал" — ГНЦВБ "Вектор" (Кольцово) | | МП "ПАТП-4" | | 20.01.1995 | 11.07.1996 | |
| 170 | Метро "Речной вокзал" — ГНЦВБ "Вектор" (Кольцово) | | ООО "БП-Транзит" | | 13.06.2012 | 11.2018 | |
| 623 | Железнодорожный вокзал "Новосибирск-Главный" — Улица Амбулаторная | | МУП "Дзержинское троллейбусное депо №1" | | 03.1997 | 31.12.2004 | |
| 1020 | СТЦ "Мега" — ГУМ "Россия" | | ИП Калашников Олег Владимирович | | 20.11.2007 | 05.2013 | |
